Redemptor hominis (4. marca 1979)
Encyklika, ktorou sa na začiatku svojho pontifikátu obracia na ctihodných bratov v biskupskej službe, na kňazov a na rehoľné rodiny, na synov a dcéry Cirkvi a na všetkých ľudí dobrej vôle.
Dives in misericordia (30. decembra 1980)
Encyklika o Božom milosrdenstve
Laborem exercens (14. septembra 1981)
Encyklika o ľudskej práci
Slavorum apostoli (2. júna 1985)
Encyklika na pamiatku evanjelizačného diela svätého Cyrila a Metoda po jedenástich storočiach
Dominum et Vivificantem (18. mája 1986)
Encyklika o Duchu Svätom v živote Cirkvi a sveta
Redemptoris Mater (25. marca 1987)
Encyklika o preblahoslavenej Panne Márii v živote Cirkvi
Sollicitudo rei socialis (30. decembra 1987)
Sociálna encyklika vydaná pri príležitosti 20. výročia encykliky Populorum progressio
Redemptoris missio (7. decembra 1990)
Encyklika o trvalej platnosti misionárskeho poslania Cirkvi
Centesimus annus (1. mája 1991)
Encyklika k stému výročiu encykliky Rerum novarum
Veritatis splendor (6. augusta 1993)
Encyklika o niektorých základných otázkach morálneho učenia Cirkvi
Buly
Inter Sanctos (29. novembra 1979)
Vyhlásenie svätého Františka z Assisi za patróna ekológov
Incarnationis mysterium (29. novembra 1998)
Bula, ktorou sa vyhlasuje Veľké jubileum roku 2000
Konštitúcie a exhortácie
Apoštolská exhortácia o osobe svätého Jozefa a jeho poslaní v živote Krista a Cirkvi
Pastores dabo vobis (25. marca 1992)
Posynodálna apoštolská exhortácia o formácii kňazov v dnešnom svete
Universi Dominici gregis (22. februára 1996)
Apoštolská konštitúcia o uprázdnení Apoštolského Stolca a o voľbe rímskeho pápeža
Vita consecrata (25. marca 1996)
Apoštolská exhortácia o zasvätenom živote a jeho poslaní v Cirkvi a vo svete
Ecclesia in America (22. januára 1999)
Apoštolská exhortácia o stretnutí so živým Ježišom, ceste k obráteniu, spoločenstvu a solidarite v Amerike
Ecclesia in Asia (6. novembra 1999)
Posynodálna apoštolská exhortácia o Ježišovi Kristovi, Spasiteľovi, a jeho poslaní lásky a služby v Áziii
Ecclesia in Europa (28. júna 2003)
Possynodálna apoštolská exhortácia
Pastores gregis (16. 10. 2003)
Posynodálna apoštolská exhortácia o biskupovi, služobníkovi evanjelia Ježiša Krista, pre nádej sveta
Listy
List Jána Pavla II. kňazom pri príležitosti Zeleného štvrtku
Salvifici doloris (11. februára 1984)
Apoštolský list o kresťanskom zmysle ľudského utrpenia
Parati semper (31. marca 1985)
Apoštolský list k Medzinárodnému roku mládeže 1985
Iuvenium Patris (31. januára 1988)
Apoštolský list na sté výročie smrti sv. Jána Bosca
Mulieris dignitatem (15. augusta 1988)
Apoštolský list o dôstojnosti a povolaní ženy
Dominicae cenae (24. februára 1980)
List o eucharistickom tajomstve a kulte
Gratissimam sane (2. februára 1994)
List rodinám v Roku rodiny
Ordinatio sacerdotalis (22. mája 1994)
Apoštolský list Jána Pavla II. biskupom katolíckej Cirkvi o kňazskej vysviacke, ktorá je rezervovaná iba mužom
Tertio millenio adveniente (10. nobembra 1994)
Apoštolský list o príprave na jubilejný rok 2000
Orientale lumen (2. mája 1995)
Apoštolský list k stému výročiu Apoštolského listu Orientalium dignitas od pápeža Leva XIII.
List ženám (29. júna 1995)
List kňazom (25. marca 1998)
List Jána Pavla II. kňazom pri príležitosti Zeleného štvrtku
Dies Domini (31. mája 1998)
Apoštolský list o svätení nedele
List kňazom (14. marca 1999)
List Jána Pavla II. kňazom pri príležitosti Zeleného štvrtku
List umelcom (4. apríla 1999)
List Jána Pavla II. umelcom
Putovanie po miestach spásy (29. júna 1999)
Apoštolský list Jána Pavla II. o putovaní na miestach spojených s dejinami spásy
Benediktínske oslavy v Subiacu (7. júla 1999)
List pri príležitosti otvorenia benediktínskych osláv XV. storočnice od príchodu sv. Benedikta, patróna Európy do Subiaca
List starším ľuďom (1. októbra 1999)
Spes aedificandi (1. októbra 1999)
Apoštolský list o vyhlásení svätej Brigity Švédskej, svätej Kataríny Sienskej a svätej Terézie Benedikty z Kríža za spolupatrónky Európy
List z Večeradla (23. marca 2000)
List všetkým kňazom Cirkvi pri príležotisti Zeleného štvrtka v Jubilejnom roku 2000
Novo millennio ineunte (6. januára 2001)
Apoštolský list na začiatku nového tisícročia
List kňazom (25. marca 2001)
List Jána Pavla II. kňazom pri príležitosti Zeleného štvrtku
List kňazom (17. marca 2002)
List Jána Pavla II. kňazom pri príležitosti Zeleného štvrtku
Misericordia Dei (7. apríla 2002)
o niektorých aspektoch slávenia sviatosti pokánia
Apoštolský list Rosarium Virginis Mariae (16. októbra 2002)
Apoštolský list o posvätnom ruženci
Spiritus et sponsa (4. decembra 2003)
Apoštolský list k 40. výročiu konštitúcie o posvätnej liturgii Sacrosanctum concilium
List kňazom (28. marca 2004)
List Jána Pavla II. kňazom pri príležitosti Zeleného štvrtku
Mane nobiscum Domine (7. októbra 2004)
(Pane zostaň s nami) Apoštolský list z príležitosti Roku Eucharistie
List kňazom (13. marca 2005)
List Jána Pavla II. kňazom pri príležitosti Zeleného štvrtku
Rýchly rozvoj
Apoštolský list Jána Pavla II. tým, ktorí sú zodpovední za spoločenské komunikačné prostriedky
Posolstvá
Posolstvo k 33. svetovému dňu spoločenských oznamovacích prostriedkov
Posolstvo k 34. svetovému dňu spoločenských oznamovacích prostriedkov
Posolstvo k 35. svetovému dňu spoločenských oznamovacích prostriedkov
Posolstvo k 36. svetovému dňu spoločenských oznamovacích prostriedkov
Posolstvo k 37. svetovému dňu spoločenských oznamovacích prostriedkov
Posolstvo k 38. svetovému dňu spoločenských oznamovacích prostriedkov
Posolstvo k 39. svetovému dňu spoločenských oznamovacích prostriedkov
Posolstvo k svetovému dňu pokoja 1.januára 1999
Posolstvo k svetovému dňu pokoja 1.januára 2000
Posolstvo k svetovému dňu pokoja 1.januára 2001
Posolstvo k svetovému dňu pokoja 1.januára 2002
Posolstvo k svetovému dňu pokoja 1.januára 2003
Posolstvo k svetovému dňu pokoja 1.januára 2004
Posolstvo k svetovému dňu pokoja 1.januára 2005
Posolstvo na 36. svetový deň modlitieb za povolania
Posolstvo na 37. svetový deň modlitieb za povolania
Posolstvo na 38. svetový deň modlitieb za povolania
Posolstvo na 39. svetový deň modlitieb za povolania
Posolstvo na 40. svetový deň modlitieb za povolania
Posolstvo na 41. svetový deň modlitieb za povolania
Posolstvo na 42. svetový deň modlitieb za povolania
Posolstvo na pôstne obdobie roku 1999
Posolstvo na pôstne obdobie roku 2000
Posolstvo na pôstne obdobie roku 2001
Posolstvo na pôstne obdobie roku 2002
Posolstvo na pôstne obdobie roku 2003
Posolstvo na pôstne obdobie roku 2004
Posolstvo na pôstne obdobie roku 2005
Posolstvo k 8. svetovému dňu chorých
Posolstvo k 9. svetovému dňu chorých
Posolstvo k 10. svetovému dňu chorých
Posolstvo k 11. svetovému dňu chorých
Posolstvo k 12. svetovému dňu chorých
Posolstvo k 13. svetovému dňu chorých
Posolstvo mládeži pri príležitosti 14. svetového dňa mládeže
Posolstvo mládeži pri príležitosti 15. svetového dňa mládeže
Posolstvo mládeži pri príležitosti 16. svetového dňa mládeže
Posolstvo mládeži pri príležitosti 17. svetového dňa mládeže
Posolstvo mládeži pri príležitosti 18. svetového dňa mládeže
Posolstvo mládeži pri príležitosti 19. svetového dňa mládeže
Posolstvo mládeži pri príležitosti 20. svetového dňa mládeže
Veľkonočné posolstvo - Urbi et Orbi (31. marec 2002)
Vianočné posolstvo - Urbi et Orbi (2003)
Veľkonočné posolstvo - Urbi et Orbi (2004)
Posolstvo na 74. svetovú misijnú nedeľu (2000)
Posolstvo na 75. svetovú misijnú nedeľu (2001)
Posolstvo na 76. svetovú misijnú nedeľu (2002)
Posolstvo na 77. svetovú misijnú nedeľu (2003)
Posolstvo na 78. svetovú misijnú nedeľu (2004)
Posolstvo na 79. svetovú misijnú nedeľu (2005)
Posolstvo k 23. svetovému dňu turizmu (2002)
Posolstvo k 24. svetovému dňu turizmu (2003)
Posolstvo k 25. svetovému dňu turizmu (2004)
Posolstvo k 86. svetovému dňu migrantov a utečencov
Posolstvo k 88. svetovému dňu migrantov a utečencov
Posolstvo k 89. svetovému dňu migrantov a utečencov
Posolstvo k 90. svetovému dňu migrantov a utečencov
Posolstvo k 91. svetovému dňu migrantov a utečencov
Príhovory Slovákom počas pastoračnej návštevy ČSFR
Návšteva Svätého Otca v SR (30. júna - 3. júla 1995)
Príhovory počas pastoračnej návštevy Slovenska
Návšteva Svätého Otca v SR (11. septembra - 14. septembra 2003)
Príhovory počas pastoračnej návštevy Slovenska